skip to main | skip to sidebar

pan-Aves

Zpět
Hlavní strana
Archiv blogu
2010
Kontakt
Napsat autorovi
Profil
O autorovi
O blogu
a co je pan-Aves?
RSS
Zdroj
Hlavní
Přeskočit k článkům

Zleva doprava: ara hyacintový (Anodorhynchus hyacinthinus), zdroj: flickr.com (JMJ32); Gigantoraptor a Alectrosaurus, autor Luis V. Rey

Downloady

Sem budou vkládány mnou vytvořené soubory volně dostupné ke stažení. Tato stránka nemá za cíl nahradit odkazy na volně dostupná PDF citovaných studií, na než bude i nadále odkazováno přímo pod příslušnými články.

matematika v biologii: fylogenetika (prezentace .pdf, 6,6 MB), [záloha na Google Docs]

Štítky

+--Scleromochlus
+Pterosauria
|--Eopterosauria
`--+Breviquartossa
    |--Rhamphorhynchidae
    `--+--Wukongopteridae
         `--+--Anurognathidae
              `--+Pterodactyloidea
                  |--Archaeopterodactyloidea
                  `--+--Pteranodontia
                       `--+--Tapejaromorpha
                           `--+--Thalassodromidae
                               `--Azhdarchidae
+--Silesauridae
`--+Dinosauria
    |--+Ornithischia
    |   |--Heterodontosauridae
    |   `--+Genasauria
    |       |--+Thyreophora
    |       |  |--Stegosauria
    |       |  `--Ankylosauria  
    |       `--+Neornithischia
    |           |--+Ornithopoda
    |           |   `--+Styracosterna 
    |           |       `--Hadrosauridae   
    |            `--+Marginocephalia
    |                |--+Ceratopsia
    |                |   `--Ceratopsidae
    |                `--Pachycephalosauria
    `--+Saurischia
        |--Herrerasauria
        `--+--+Sauropodomorpha
            |   `--+Plateosauria
            |       |--Plateosauridae
            |       `--+--Massospondylidae    
            |           `--+Sauropoda
            |               |--Diplodocoidea
            |               `--+Macronaria
            |                   |--Brachiosauridae
            |                   `--Titanosauria
             `--+Theropoda
                 |--Ceratosauria
                 `--+Tetanurae
                     |--Megalosauroidea
                     `--+--Carnosauria
                         `--+Coelurosauria
                             `--+--Tyrannosauroidea
                                 `--+Maniraptora
                                     `--+Aves
                                         |--Anchiornis
                                         `--Neornithes

Témata blogu v obrazech

Hlavní tematické okruhy blogu pan-Aves.

Ptáci a jejich původ, vznik peří a letu

Ptáci a jejich původ, vznik peří a letu

(Deinonychus - John Conway)

Aktuálně o původu ptáků

Pterosauři

Pterosauři

(Nyctosaurus - Lida Xing)

Aktuálně o pterosaurech

Dinosauři

Dinosauři

(Tyrannosaurus - Raúl Martín)

Aktuálně o dinosaurech

Fylogenetika

Fylogenetika

Lewis et al. 2014: 2 – "Generation of posterior predictive data sets ỹ^(k) under a HKY substitution model for a four-taxon problem"

Aktuálně o fylogenetice

Dinosauria (fosilní)

DinoGoss (Matt Martyniuk)
Dinosaur Mailing List
Dinosauria – Palaeos.org
Dinosaurs: A Natural History (Thomas Holtz)
Encyklopedia Dinozaury.com! (polski)
Evolutionary Palaeobiology: Evolving science in a living world (Joe Keating, David Button)
Index of /~tholtz/G104/handouts
Lusodinos: Dinossauros de Portugal (Octávio Mateus) (em português)
Mesozoico.com.ar: Portal Paleontológico Argentino
Mikko's Phylogeny Archive – Dinosauria
Paleobirding: What Birds Looked Like 125 Million Years Ago (Daniela Hernandez)
Penguinology
Pseudoplocephalus (Victoria Arbour)
Saurian (Mark Wildman)
Sauropoda Central
The Bite Stuff (Jaime A. Headden)
The Open Dinosaur Project
The Palaeobiology and Biodiversity Research Group
The Sauropodomorph Database (Mickey Mortimer)
The Theropod Database (Mickey Mortimer)
Tyrannosauroidea central (Thomas Carr)

Dinosauria (žijící)

BirdLife International
Aves—A Taxonomy in Flux (John H. Boyd)
The Ornithology Blog v2.0 (Christopher Witt a další)
BirdForum
The Clements Checklist of Birds of the World
Kompletna lista ptaków świata (polski)
The Internet Bird Collection
A Global Phylogeny of Birds
Raptors of the World (Raptor Research Foundation)
eBird
xeno-canto
Tempo & Mode (Rafael Maia)
The Birdbooker Report (Ian Paulsen)

Fylogenetika

phylobabble.org
Workshop in Applied Phylogenetics
TreeThinkers (Bob Thomson a další)
phyloseminar.org (Frederick Matsen a další)
PhyloWiki (Nicholas Matzke a další)
The Bayesian kitchen (Nicolas Lartillot)
Open Tree of Life
Bayesian Phylogenetics (Paul O. Lewis)
The State of Bayesian Phylogenetics: Bayes for the Uninitiated (Joseph W. Brown)
bioMCMC (Leonardo de Oliveira Martins)
Filosofía, especie y sistemática
A Three-Pound Monkey Brain (Mike Keesey)
iPhylo (Roderic Page)

Open access žurnály

Seznam open-access paleontologických žurnálů Matta Wedela
Acta Palaeontologica Polonica
American Museum Novitates
Anais da Academia Brasileira de Ciências
The Auk (po 24 měsících + archiv)
Avian Research / Chinese Birds
Biology Letters (po 12 měsících)
BMC Evolutionary Biology
BMC Genomics
The Condor (po 24 měsících + archiv)
Genome Biology
Genome Biology and Evolution
GigaScience
Memoir of the Fukui Prefectural Dinosaur Museum
Molecular Biology and Evolution (po 12 měsících)
Palaeontologia Electronica
Palaeontology (1957–1998)
PeerJ
PLOS Biology
PLOS ONE
Proceedings of the National Academy of Sciences (po 6 měsících)
Proceedings of the Royal Society B (po 12 měsících)
Scientific Reports
Systematic Biology (po 12 měsících, od roku 1996)
Vertebrata PalAsiatica
Volumina Jurassica
ZooKeys

Mrtvé weby

Tetrapod Zoology v1.0 (Darren Naish)
Tetrapod Zoology v2.0 (Darren Naish)
The Ornithology Blog v1.0 (Christopher Witt a další)
dechronization (Dan Rabosky a další)
FinchWench: the world is an aviary
H2VP (Michael Habib, Justin Hall)
Pick & Scalpel - WitmerLab at Ohio University (Larry Witmer a další)
The Open Source Paleontologist (Andrew Farke)
Raptor's Nest (Manabu Sakamoto)
Not Exactly Rocket Science v1.0 (Ed Yong)
Laelaps v1.0 (Brian Switek)
Dinosaur Tracking (Brian Switek)
Computer cladistics / ¡Cladística a la lata!
When Pigs Fly Returns (Zachary Miller)

V češtině a slovenštině

České paleontologické fórum
Wild Prehistory (Daniel Madzia)
Evolutionary Vertebrate Zoology (Matej Dolinay)
EasyBlog (Jiří Meixner)
Evoluční paleontologie (Daniel Madzia)
viventibus esse (Matúš Hyžný)
Za ptáky do zoologických zahrad (Česká společnost ornitologická)

Může se hodit

BayesianBiologist (Corey Chivers)
Catalogue of Organisms (Chris Taylor)
Paleontología y Evolución en la UCM
Genomicrocosm (Alexander Suh)
Life in the Cenozoic Era (Aaron Woodruff)
Palaeoblog (Michael J. Ryan)
Not Exactly Rocket Science v2.0 (Ed Yong)
GrrlScientist | Science
why I hate theropods (Nick Gardner)
Laelaps v2.0 (Brian Switek)
Secret Cladogram of Archosauria
Holliday Lab at Mizzou (Casey Holliday, Nick Gardner a další)

Licence

Licence Creative Commons

Translate

Archiv

▼ 2015 (11)
- ▼ listopadu 2015 (1)
  - ▼ 11/28 (1)
    - Dinosauři v Zoo Praha, díl 3. – Afroaves
- ► září 2015 (1)
  - ► 09/08 (1)
- ► března 2015 (9)
  - ► 03/12 (1)
  - ► 03/11 (1)
  - ► 03/10 (1)
  - ► 03/09 (1)
  - ► 03/08 (1)
  - ► 03/07 (1)
  - ► 03/06 (1)
  - ► 03/05 (1)
  - ► 03/04 (1)

► 2014 (5)
- ► prosince 2014 (1)
  - ► 12/12 (1)
- ► listopadu 2014 (2)
  - ► 11/23 (1)
  - ► 11/11 (1)
- ► srpna 2014 (1)
  - ► 08/11 (1)
- ► července 2014 (1)
  - ► 07/28 (1)

► 2013 (3)
- ► prosince 2013 (1)
  - ► 12/28 (1)
- ► února 2013 (1)
  - ► 02/27 (1)
- ► ledna 2013 (1)
  - ► 01/04 (1)

► 2012 (29)
- ► prosince 2012 (1)
  - ► 12/21 (1)
- ► listopadu 2012 (3)
  - ► 11/30 (1)
  - ► 11/04 (1)
  - ► 11/03 (1)
- ► října 2012 (2)
  - ► 10/28 (1)
  - ► 10/19 (1)
- ► září 2012 (1)
  - ► 09/24 (1)
- ► srpna 2012 (2)
  - ► 08/26 (1)
  - ► 08/23 (1)
- ► června 2012 (2)
  - ► 06/28 (1)
  - ► 06/21 (1)
- ► května 2012 (2)
  - ► 05/24 (1)
  - ► 05/06 (1)
- ► dubna 2012 (5)
  - ► 04/29 (1)
  - ► 04/22 (1)
  - ► 04/09 (1)
  - ► 04/08 (1)
  - ► 04/05 (1)
- ► března 2012 (2)
  - ► 03/25 (1)
  - ► 03/09 (1)
- ► února 2012 (8)
  - ► 02/29 (1)
  - ► 02/25 (1)
  - ► 02/23 (1)
  - ► 02/21 (1)
  - ► 02/18 (2)
  - ► 02/10 (1)
  - ► 02/02 (1)
- ► ledna 2012 (1)
  - ► 01/06 (1)

► 2011 (63)
- ► prosince 2011 (5)
  - ► 12/28 (1)
  - ► 12/26 (1)
  - ► 12/22 (1)
  - ► 12/09 (1)
  - ► 12/01 (1)
- ► listopadu 2011 (4)
  - ► 11/29 (1)
  - ► 11/25 (1)
  - ► 11/10 (1)
  - ► 11/06 (1)
- ► října 2011 (5)
  - ► 10/29 (1)
  - ► 10/26 (1)
  - ► 10/16 (1)
  - ► 10/12 (1)
  - ► 10/01 (1)
- ► září 2011 (2)
  - ► 09/13 (1)
  - ► 09/03 (1)
- ► srpna 2011 (3)
  - ► 08/21 (1)
  - ► 08/10 (1)
  - ► 08/06 (1)
- ► července 2011 (8)
  - ► 07/28 (1)
  - ► 07/26 (1)
  - ► 07/21 (1)
  - ► 07/18 (1)
  - ► 07/14 (1)
  - ► 07/10 (1)
  - ► 07/07 (1)
  - ► 07/02 (1)
- ► června 2011 (4)
  - ► 06/30 (1)
  - ► 06/18 (1)
  - ► 06/15 (1)
  - ► 06/11 (1)
- ► května 2011 (8)
  - ► 05/31 (1)
  - ► 05/29 (1)
  - ► 05/22 (1)
  - ► 05/21 (1)
  - ► 05/15 (1)
  - ► 05/11 (1)
  - ► 05/08 (1)
  - ► 05/04 (1)
- ► dubna 2011 (8)
  - ► 04/29 (1)
  - ► 04/26 (1)
  - ► 04/25 (1)
  - ► 04/24 (1)
  - ► 04/22 (1)
  - ► 04/21 (1)
  - ► 04/14 (1)
  - ► 04/01 (1)
- ► března 2011 (7)
  - ► 03/29 (1)
  - ► 03/24 (1)
  - ► 03/21 (1)
  - ► 03/19 (1)
  - ► 03/14 (1)
  - ► 03/03 (1)
  - ► 03/01 (1)
- ► února 2011 (5)
  - ► 02/27 (1)
  - ► 02/26 (1)
  - ► 02/19 (1)
  - ► 02/12 (1)
  - ► 02/09 (1)
- ► ledna 2011 (4)
  - ► 01/23 (1)
  - ► 01/20 (1)
  - ► 01/13 (1)
  - ► 01/07 (1)

► 2010 (62)
- ► prosince 2010 (6)
  - ► 12/30 (1)
  - ► 12/28 (1)
  - ► 12/18 (1)
  - ► 12/16 (1)
  - ► 12/10 (1)
  - ► 12/09 (1)
- ► listopadu 2010 (4)
  - ► 11/28 (1)
  - ► 11/27 (1)
  - ► 11/14 (1)
  - ► 11/07 (1)
- ► října 2010 (5)
  - ► 10/24 (1)
  - ► 10/17 (1)
  - ► 10/15 (2)
  - ► 10/08 (1)
- ► září 2010 (5)
  - ► 09/26 (1)
  - ► 09/23 (1)
  - ► 09/12 (1)
  - ► 09/10 (1)
  - ► 09/01 (1)
- ► srpna 2010 (7)
  - ► 08/31 (1)
  - ► 08/26 (1)
  - ► 08/18 (1)
  - ► 08/10 (1)
  - ► 08/09 (1)
  - ► 08/07 (1)
  - ► 08/05 (1)
- ► července 2010 (9)
  - ► 07/31 (1)
  - ► 07/30 (1)
  - ► 07/26 (1)
  - ► 07/25 (1)
  - ► 07/23 (1)
  - ► 07/18 (1)
  - ► 07/14 (1)
  - ► 07/08 (1)
  - ► 07/04 (1)
- ► června 2010 (2)
  - ► 06/20 (1)
  - ► 06/09 (1)
- ► května 2010 (5)
  - ► 05/30 (1)
  - ► 05/28 (1)
  - ► 05/21 (1)
  - ► 05/15 (1)
  - ► 05/08 (1)
- ► dubna 2010 (5)
  - ► 04/30 (1)
  - ► 04/27 (1)
  - ► 04/18 (1)
  - ► 04/09 (1)
  - ► 04/03 (1)
- ► března 2010 (8)
  - ► 03/28 (1)
  - ► 03/22 (1)
  - ► 03/21 (1)
  - ► 03/20 (1)
  - ► 03/14 (1)
  - ► 03/09 (1)
  - ► 03/06 (1)
  - ► 03/03 (1)
- ► února 2010 (2)
  - ► 02/28 (1)
  - ► 02/16 (1)
- ► ledna 2010 (4)
  - ► 01/30 (1)
  - ► 01/14 (1)
  - ► 01/01 (2)

Stránky

Domovská stránka
Kontakt
Downloady

Témata

Arborealita (5) Barva peří (8) Bayes (11) Biodiverzita (1) Birds Are Not Dinosaurs (4) CT sken (8) Chování (15) Datace (20) Dýchání (3) Ekologie (28) Embryologie (9) Endotermie (5) Evoluce (77) FyloKód (4) Fylogenetika (55) Fylogeneze "prosauropodů" (3) Geografie (31) Hmotnost (10) Homologie prstů (6) Ichnofosilie (6) Kaledonské vrány (1) Kreacionizmus (3) Let (25) Molekuly (33) Morfologie (71) Muzea (1) Názvosloví (12) Ochrana přírody (3) Ontogeneze (30) Osteodermy (3) Peří (29) Pneumatizace kostry (7) Potrava (9) Ptačí kostra (22) Původ pterosaurů (4) Původ ptáků (19) Recenze (6) Reprodukční biologie (8) Retropozony (5) Sexuální dimorfizmus (7) Slovník (2) Smysly (3) Software (1) Splitting + lumping (10) Stratigrafie (9) Tafonomie (12) Tvar lebky (19) Vejce (11) Velikost (16) Vymírání K/P (5) Zoo (3) Zrušení "druhu" (3) Ztráta letu (13) Zuby (10)

Aktuální komentáře

Oblíbené příspěvky

Kreacionizmus verzus fakta: případ Eodromaeus

Kreacionizmus potřebuje důkladnou medializaci, a proto se tato podskupina (převážně) amerických náboženských fundamentalistů ráda vrhá p...
Zjišťování pterosauří hmotnosti segmentováním 3D modelů: fantastické implikace pro druh Quetzalcoatlus northropi

Práce, jejíž jméno zní "Pterosaur body mass estimates from three-dimensional mathematical slicing", určitě vypadá jako čistě ...
Fosilie nelžou, kreacionisté ano (recenze)

Dnes se budu věnovat jednomu neobvyklému tématu - kreacionizmu. Dobře zdokumentované vývojové série vždycky způsobovaly kreacionistům p...
Recenze: Úžasný svět dinosaurů (Vladimír Socha)

Není jednoduché Úžasný svět dinosaurů recenzovat. Především znám autora osobně: z několika setkání a hlavně čtyřletého kontaktu na Čes...

Oblíbené blogy

10,000 Birds

Species Spotlight: The Sulawesi Pitta - I don’t think the Sulawesi Pitta and I will ever become close friends. Sorry to say that. Here is why. Given that there are a few papers out on the economi...
před 3 hodinami
Sauropod Vertebra Picture of the Week (Mike Taylor, Matt Wedel a Darren Naish)

Burn it all down - Clarivate is the content-hoarding corporation that owns ProQuest, the Web of Science and EndNote, among many other services widely used in academia. Plus a...
před 2 dny
Theropoda (Andrea Cau)

Jurassic Park Reboot - I protagonisti - Uno degli elementi vincenti del primo Jurassic Park, sia nella versione letteraria che cinematografica, è l'assortimento di personaggi umani coinvolti. Al...
před 6 dny
The Theropod Database Blog (Mickey Mortimer)

No pygostyle for Baminornis - This week's big news was *Baminornis *(Chen et al., 2025), a bird with a supposed large pygostyle from a well dated Tithonian locality (Nanyuan Formation...
Před 1 týdnem
Phylogenetic Tools for Comparative Biology (Liam Revell)

A simple custom R contour plotter - Base R and other contributed R packages have a wide range of functions for graphing contour plots and surfaces. In working on a project I needed to crea...
Před 1 týdnem
Raptormaniacs

Review of 2024 - Last year was a fairly productive one for me. Two research papers I co-authored came out, one on the scientific importance of fossil avialans from the Ma...
před 3 týdny
Dave Hone's Archosaur Musings (Dave Hone)

A giant Rhamphorhynchus in London - Typical, you wait ages for a paper on Rhamphorhynchus ontogeny and then they all come at once. Ok, maybe not that quickly, but this is now the second paper...
před 1 měsícem
March of the Fossil Penguins (Dan Ksepka)

Penguin Genomes Unveiled - Today, the Penguin Genome Consortium announced that they have completed genomes of all living penguin species. This international team includes research fo...
před 5 lety
Chinleana (Bill Parker)

Histological Evidence of Trauma in Dicynodont Tusks - *Whitney, M. R., Ting Tse, Y., and C. A. Sidor. 2019. Histological evidence of trauma in tusks of southern African dicynodonts. Palaeontologia Africana 5...
před 6 lety
dinosaurpalaeo (Heinrich Mallison)

Photogrammetry tutorial 12: my workflow for Agisoft Metashape as a diagram - EDIT 06/2022: added chart for using depth map based mesh generation. Updated other charts to new program name. The last tutorial on how to handle a project...
před 6 lety
Tetrapod Zoology v3.0 (Darren Naish)

The End of Tetrapod Zoology, ver 3 - Good-bye -- Read more on ScientificAmerican.com
před 6 lety
Nemagraptus gracilis (David Bapst)

'T151: New Approaches to Phylogenetic Paleobiology' at GSA Annual Meeting 2016. Sept 25-28 in Denver - Hello all, a little reminder, as the abstract submission date (July 12th) is fast approaching... We are pleased to announce a topical session scheduled for...
před 8 lety
Pterosaur.net Blog

A bit more about the AMNH Exhibit - Many thanks to Dave Hone for posting the great photos from Steve Cohen of the new AMNH Exhibit. I have been meaning to post about the exhibit over a month ...
před 10 lety

Pterosauria

Azhdarchid Paleobiology (Darren Naish a Mark Witton)
Comments on the Phylogeny of the Pterodactyloidea (Alexander Kellner)
Mesozoic Monsters (Steve Vidovic)
Mikko's Phylogeny Archive – Pterosauria
Musings of a Clumsy Palaeontologist (Elizabeth Martin)
PteroTerra (Matthew McLain, Brad Chase a Eric Bryant)
Pterosaur.net (Mark Witton, Mike Habib, Dave Hone, Darren Naish a další)
Pterosauria – Palaeos.org
The Pterosaur Database (Paul Pursglove)
The Pterosaur Database – blog (Paul Pursglove)
The Pterosauria (Brian Andres)
Wikipedia – List of pterosaur genera

Knihy online

FL Agnolín, Novas FE (2013) Avian Ancestors: A Review of the Phylogenetic Relationships of the Theropods Unenlagiidae, Microraptoria, Anchiornis and Scansoriopterygidae (kompletní)
MK Brett-Surman, TR Holtz Jr, JO Farlow, eds. (2012) The Complete Dinosaur, 2nd edition
E Buffetaut, J-M Mazin, eds. (2003) Evolution and Palaeobiology of Pterosaurs
M-H Chen, L Kuo, PO Lewis (2015) Bayesian Phylogenetics: Methods, Algorithms, and Applications
LM Chiappe, LM Witmer, eds. (2002) Mesozoic Birds: Above the Heads of Dinosaurs
L Christidis, WE Boles (2008) Systematics and Taxonomy of Australian Birds
GJ Dyke, G Kaiser (2011) Living Dinosaurs: The Evolutionary History of Modern Birds
DA Eberth, DC Evans (2014) Hadrosaurs
G Mayr (2009) Paleogene Fossil Birds
PF Murray, P Vickers-Rich (2004) Magnificent Mihirungs: The Colossal Flightless Birds of the Australian Dreamtime
SJ Nesbitt, JB Desojo, RB Irmis, eds. (2013) Anatomy, Phylogeny and Palaeobiology of Early Archosaurs and their Kin
JM Parrish, RE Molnar, PJ Currie, EB Koppelhus, eds. (2013) Tyrannosaurid Paleobiology
GS Paul (2002) Dinosaurs of the Air: The Evolution and Loss of Flight in Dinosaurs and Birds
MJ Ryan, BJ Chinnery-Allgeier, DA Eberth, eds. (2010) New Perspectives on Horned Dinosaurs: The Royal Tyrrell Museum Ceratopsian Symposium
H-P Schultze, L Trueb, eds. (1991) Origins of the Higher Groups of Tetrapods: Controversy and Consensus
MP Witton (2013) Pterosaurs
TH Worthy, RN Holdaway (2002) The Lost World of the Moa: Prehistoric Life of New Zealand

Stránky autorů a jejich publikace

Volné PDF knihovny

The Polyglot Paleontologist (Matthew Carrano a další)
Avian Palaeontological Literature Online (SAPE)
Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology – Index of papers
Bibliography and Archive of the Pterosauria (Chris Bennett)
The Theropod Archives (Robert Taylor a další)
Mabula Ground Hornbill Project – Library & Resources
Coraciiformes Taxon Advisory Group
Assembling the Tree of Life: Deep Avian Phylogenetics (Edward Braun)
The American Museum of Natural History DSpace Digital Repository
Marshovy publikace (Matt Wedel)
Bibliographie sur les Spinosauridae (Christophe Hendrickx)
Hornbill Watch – Resources

Zpět
Hlavní strana
Minulý blog
Starší verze blogu
Na ČPF
jako "radevic dyn"
Na PhyloNom
pod svým jménem
RSS
Zdroj
Nahoru
Návrat nahoru

Grid Focus by Derek Punsalan 5thirtyone.com. Converted by Blogger Buster